6月15-18日,歐洲人類遺傳學大會在瑞典哥德堡舉行,華大集團在大會上發(fā)布了“高清”組裝基因組解決方案及標準。該方案及標準基于華大旗下子公司華大智造自主測序技術DNBSEQTM和stFLR,開啟了基因組測序“全高清”時代,對更全面和準確地獲取遺傳信息有著里程碑式的突破。
據(jù)悉,目前,由于測序技術的局限性,大多數(shù)全基因組測序只能獲取單倍體數(shù)據(jù)。但人類基因組是二倍體,即我們從父母親那里各遺傳到一套染色體,這些染色體之間的變異和差異,可能對個體的表型產(chǎn)生重要影響,而新發(fā)布的高精度基因組標準和解決方案,將有助解決這一問題。
據(jù)介紹,華大將這次公布的基因測序標準簡稱為“676”標準。發(fā)布這一標準的華大智造首席科學家Rade Drmanac在大會現(xiàn)場表示,如果說過去短讀長測序比對參考基因組,繪制出的是一幅打著“馬賽克”的“肖像畫”,那么基于“676”標準的從頭組裝二倍體基因組數(shù)據(jù),則將基因組測序真正帶入“全高清”時代。
Rade Drmanac博士在現(xiàn)場講解“676標準”
“‘676’標準可單獨組裝每個人的基因組,并且不依賴于參考基因組,能提供更加全面和準確的遺傳信息,將有助于推動個性化醫(yī)療的實現(xiàn)。”Drmanac說。
據(jù)悉,在即將上市的測序平臺上,“676”標準的全基因組測序成本預計為1000美元。
本次會議上,華大還計劃將“676”標準應用于新開展的基因組項目,該計劃將在未來幾年內對1000個樣本進行測序,以在不同人群中創(chuàng)建高質量的參考基因組和更為完整的人類基因組多樣性數(shù)據(jù)庫。屆時,這些數(shù)據(jù)將免費向研究者開放。目前該項目正公開收集樣本,并招募合作者加入。
除發(fā)布“676”精準基因組標準和解決方案外,華大還在本次大會上宣布了與生物信息學軟件公司Sentieon的合作,Sentieon是基因組裝配和變體調用解決方案的領導者,雙方將共同開發(fā)基于stLFR技術的基因組組裝軟件,實現(xiàn)低成本高精度的單體型定相基因組從頭組裝。
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原文標題:基因組不再打“馬賽克” 華大發(fā)布高精度基因組標準及解決方案
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